Особенности работы системы защиты конфигураций платформы 1С:Предприятие при запуске в терминальном режиме.
Общие положения
Система защиты конфигураций поддерживает работу в терминальном режиме только для USB ключей, при этом клиентские ключи подключаются к серверу терминалов в количестве, равном необходимому числу терминальных сессий. Т.е. сколько ключей подключено к серверу терминалов, в стольких терминальных сессиях будет возможна работа защищенной конфигурации. 
Настройка сервера терминалов
Для запуска системы защиты в терминальном режиме необходимо разрешить терминальному пользователю создавать глобальные объекты (Global Objects).
Для этого необходимо войти:
 Панель управления (Control Panel)
•	 Администрирование (Administrative Tools)
•	 Политика безопасности (Security Policy) - Локальная или серверная, в зависимости от настроек сети.
•	 Назначение прав пользователя (User rights)
•	 Создание глобальных объектов (Create global objects) 
Элементу политики Создание глобальных объектов (Create global objects) добавить пользователя или группу пользователей (например, Remote Desktop Users для Windows 2003).
После изменения настроек необходимо завершить терминальные сессии (или перезагрузить сервер).
Для того чтобы на терминальном сервере запускалась только 1С
 Панель управления (Control Panel)
•	 Администрирование (Administrative Tools)
•	 Управление компьютером
•	 Пользователи
Выбираем пользователя - свойства
На закладке «Среда»
При входе в систему запускать следующую программу:
"C:\Program Files\1Cv8\bin\1cv8.exe" enterprise /n"ИМЯ ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ 1С" /f"ПУТЬ К БАЗЕ" /p"ПАРОЛЬ 1С"
Рабочая папка: C:\Program Files\1Cv8\bin\

Дополнительно: советы 1С по настройкам ключа
Вопрос: Если входить в 1С:Предприятие8 локально или через терминал (в режиме  console), то программа запускается.  Если просто попытаться пойти через терминал, то выводится сообщение "Ключ защиты не обнаружен". По сети в файловом варианте 1С:Предприятие8 тоже работает.
        На сервере установлен Windows Server  2003 SP2 32bit. На нем установлен USB ключ защиты: "1С:Предприятие8. Клиентская лицензия на 10 рабочих мест. Также на нем установлен менеджер  лицензий 8.31 как служба. Сервер исполняет роли: "файл сервера", сервера терминалов, "принт сервера". 

Ответ 1С (действительно решивший проблему): 
Используйте на сервере терминалов nethasp.ini следующего содержания:
[NH_COMMON]
NH_IPX = Disabled
NH_NETBIOS = Disabled
NH_TCPIP = Enabled
NH_SESSION = 4
NH_SEND_RCV = 2
[NH_TCPIP]
NH_SERVER_ADDR = 192.168.113.29   ; укажите реальный IP-адрес менеджера лицензий
NH_TCPIP_METHOD = UDP
NH_USE_BROADCAST = Disabled
В версии 8.2 nethasp.ini ищется в следующем порядке: 
c:\Program Files\1cv82\8.2.**.**\bin\conf 
c:\Documents and Settings\пользователь\Local Settings\Application Data\1C\1Cv82\conf 
каталог, на который указывает файл c:\Program Files\1cv82\8.2.**.**\bin\conf\conf.cfg (по умолчанию - C:\Program Files\1cv82\conf) 
c:\Documents and Settings\All Users\Application Data\1C\1Cv82\conf 
Откуда именно был прочитан nethasp.ini, можно посмотреть в технологическом журнале, если включить вывод событий hasp. 
Убедитесь, что у Вас используется именно тот nethasp.ini, который настраивали.